Karl Schlögel a obtenu le statut de professeur émérite en 2013. Il enseigne à l'Université européenne Viadrina de Francfort depuis 1994 et a également enseigné à l’Université de Constance.
Ses recherches portent principalement sur deux thématiques : l’histoire culturelle et l’histoire de l’Europe de l’Est.
En 1986, le quotidien allemand Der Berliner Tagesspiegel lui a octroyé le prix du meilleur essai. Par la suite, d’autres prix lui ont été décernés notamment le prix européen de l’essai Charles Veillon en 1990.