Isabelle Léglise est directrice de recherche au CNRS au sein de l'UMR 8202 SEDYL qu'elle a dirigé pendant 6 ans. Ses travaux sur le multilinguisme en Guyane, au Brésil et au Surinam l'ont amenée à se spécialiser dans les domaines de la variation et de l'hétérogénéité linguistique en situation de contact de langues, des pratiques langagières plurilingues et hétérogènes, de la transmission des langues en situation de mobilité notamment au sein de familles transnationales, et de la prise en compte du plurilinguisme dans les domaines de l’éducation et de la santé.

Elle mobilise dans ses travaux les cadres de l'anthropologie linguistique, de la sociolinguistique et de l'analyse de discours.

En Amazonie comme en Asie du Sud Est (Cambodge), elle est particulièrement impliquée dans des projets de coopération scientifique en lien avec l'IRD dont elle coordonne la Fédération F3S (Sciences Sociales au Sud).