Annie DUPUIS est diplômée de psychologie, docteur en ethnologie, vidéaste, rattachée au CNRS jusqu'en 2008. Elle débute sa carrière au département d’Afrique noire du musée de l’Homme en 1968 où elle est la collaboratrice de Michel Leiris.
Elle a effectué de nombreuses missions de terrain au Gabon puis au Togo, participé dès sa création en 1986 à la rédaction de la revue Gradhiva en tant que coordinatrice documentaire et scientifique.
Elle a conçu plusieurs expositions d’art et d’ethnologie et est l’auteur de nombreux articles. Elle enseigne à l’École du Louvre et a assuré plusieurs années un enseignement à l’École doctorale du muséum national d’histoire naturelle.
Elle a réalisé plusieurs films primés dans des festivals internationaux.
Ses domaines de recherche concernent essentiellement l’Afrique : « Du terrain au musée » : culture matérielle et notion d’objet ethnographique, muséologie. Histoire de l’ethnologie. Anthropologie et histoire des arts. Problématique de la création. Anthropologie de la naissance et de la petite enfance, initiation.